因應武漢肺炎疫情持續延燒，中央流行疫情指揮中心提升至一級開設，屏東縣政府府呼籲大型宗教活動暫緩或調整辦理規模，已獲得屏東縣道教會、屏東佛教會、全屏東基督教聯盟全人發展關懷協會、一貫道台灣省分會屏東縣支會及慈濟基金會屏東分會等支持；其中東港朝隆宮原訂3月7日的巡安護境健走和4月10到12日的媽祖巡安護境文化祭活動，屏東佛教會佛教會館動土典禮、浴佛祈福法會及會員代表大會均已延期、屏東市玄聖殿遶境活動取消、屏東玉皇宮春祭遊行取消、屏東市聖帝廟慈鳳宮自春節迄今暫停聖母聖誕祝壽、停止發送平安壽麵活動及夜間媽祖學院停課、慈濟屏東分會共修課程均採視訊方式、一貫道台灣省分會屏東縣支會自宗教祈福會後一切活動取消、全屏東基督教聯盟協會鼓勵教會取消聚會或縮小規模、東港東隆宮除為消除武漢肺炎舉辦「三朝禳災掃除瘟疫護國佑民大法會」外，其他相關活動配合政府防疫無限期延期、屏東市紫霄帝闕玄天上帝及恆春高山巖福德宮也配合縣府政策取消或暫緩相關活動。

民政處表示，宗教是安定社會人心重要的力量，為避免疫情蔓延造成人心惶惶，屏東各界宗教團體都表示支持縣府防疫政策。縣府尊重宗教自主原則，但更以「防疫至上」標準，希望各項大型聚會活動可以等到疫情控制後再行辦理，或者簡化流程及縮小規模。傳統宮廟遶境活動是台灣傳統民俗慶典之ㄧ，但受到武漢肺炎疫情的影響，必須稍做調整，包含縮短參拜流程及減少人潮聚集，此外，參與活動的信眾們也要做好自主管理，勤洗手及戴口罩，並與人群保持適度距離，以降低感染風險。

民政處進一步表示，各種宗教活動都不應該成為防疫破口，除應自行做好相關防疫措施外，並應考慮延期或停辦，以免疫情擴散。對於即將到來的三月「瘋媽祖」遶境活動參與人潮擁擠且持續時間較長，可能成為防疫漏洞，縣府持續呼籲境內大型宗教活動暫緩，或調整辦理規模，都已獲得相關宗教團體支持。另外，縣府也拜託宗教團體或領袖可以轉知或呼籲所屬會員共同支持政府防疫政策，如在防疫期間有規劃辦理長時間人潮擁擠且密集接觸的活動，可以建議暫緩辦理或是疫情情況再行評估。