圖:許多遊客直接在溪石上烤肉，留下黑色的炭灰(小鎮資訊攝)
遊客湧入也帶來負面效應，遊客炊煮烤肉後製造不少垃圾，溪石也因木炭燒烤留下一從黑色的痕跡，加上海神宮的大小水潭有好幾處，有些遊客因好奇深入沒有救生員水域的山林秘境探險，今年3月還發生溺水死亡意外，原本清幽舒適的家園因此變質，其實國有山林、溪流的權責在中央，部落居民雖看不下去，也無可奈何。
圖:每到假日海神宮擠進滿滿人潮(小鎮資訊攝)
茂管處回應:「在莫拉克風災之前，茂管處有在海神宮建設腳踏車步道，但後來因颱風沖毀，目前有在跟三地門鄉研議重新規劃，目前海神宮不是他們負責管轄。」
圖:鄉公所在危險區域派駐救生員，但只有在熱門水域(小鎮資訊攝)
三地門鄉鄉公所表示:「目前海神宮是公所管轄區域，不過管理的話則是交由社區，鄉公所只能派員柔性勸導，很多時候還會被遊客反嗆。」
圖:遊客炊煮烤肉後留下垃圾，烤肉濃煙飄散山林(小鎮資訊攝)
當地族人表示:他們也對遊客亂丟垃圾和破壞環境感到很困擾，有些遊客覺得有收停車費等同於河川清潔費，就大肆在河川烤肉亂丟垃圾，但卻不知道停車的地方是私有地，本來就應該要使用者付費。
但根據《小鎮》的深入追蹤，海神宮長期面臨私有地與公有地的複雜問題，私有地主除了收取私有地的停車費外，另外也會利用大型遮陽傘占用河川旁的空地（公有地），藉由租借名義向遊客收取不合理的費用，衍伸出部落間的利益衝突，也造成公部門在規劃管理上的難度，而三地門鄉公所也表示將積極跟茂管處合作，目前已完成三次部落會議，和地主達成共識，希望儘快推動執行海神宮的管理辦法，三地門鄉公所也呼籲前往的民眾務必要把垃圾帶走，保護美麗的山川。
圖:秘境變質，部落居民雖看不下去，也無可奈何(小鎮資訊攝)